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Musa acuminata

アセンブルされた配列

Musa acuminata subsp. malaccensis , Wild banana (acuminata, ssp. Malaccensis)) , バナナ野生種 (acuminata種, malaccensis亜種) , Musa acuminata subsp. banksii , Wild Banana (acuminata, ssp. banksii) , バナナ野生種 (acuminata種, banksii亜種) , GenBank , EMBL , DDBJ

ゲノム配列名 Bio Sample アセンブリレベル アノテーション
(gff / gff3)
遺伝子
(cds / gene)
Hayai
Annotation
ZEN
トランスクリプト
(cDNA / mRNA)
タンパク
(pep / aa)
ダウンロード JBrowse コメント

musa_acuminata_v2

subsp. malaccensis, DH-Pahang

Chromosome

A doubled-haploid genotype, obtained from the Musa acuminata subspecies malaccensis accession 'Pahang'

Musa_acuminata_ssp_banksii_2.0

accession Banksii, spp. banksii, PT-BA-00024

Chromosome

NA

SRA配列

配列の種類

Bio Sample 配列名 Accession JBrowse コメント

musa_acuminata_v2

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

ERA548912

ERX1268311

alias:sample_AYP_4641; sample Name:ERS1023617

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

ERA177031

ERX179492

alias:sample_AEH_4641; sample Name:ERS187915

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

ERA177031

ERX179495

alias:sample_AEH_4641; sample Name:ERS187915

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

ERA177031

ERX179497

alias:sample_AEH_4641; sample Name:ERS187915

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

ERA177031

ERX179498

alias:sample_AEH_4641; sample Name:ERS187915

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

ERA177031

ERX179501

alias:sample_AEH_4641; sample Name:ERS187915

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Cavendish

ERA2028521

ERX3436629

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Cavendish

ERA2028521

ERX3436630

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Cavendish

ERA2028893

ERX3437117

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Cavendish

ERA2028893

ERX3437118

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Cavendish

ERA2028893

ERX3437119

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Cavendish

ERA2028893

ERX3437120

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Cavendish

SRA617823

SRX3259632

AAA Group, subgr. Cavendish

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Pisang_Kra

SRA688590

SRX3931155

subsp. malaccensis

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Pisang_Mas

SRA688590

SRX3931156

subgr.Sucrier

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

BaXiJiao

SRA688590

SRX3931157

AAA Group, subgr. Cavendish 'BaXiJiao'

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Gros Michel

SRA688590

SRX3931158

AAA Group, subgr. Gros Michel

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Maia Oa

SRA688264

SRX3946209

subsp. acuminata var. zebrina

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Maia Oa

SRA688264

SRX3946212

subsp.acuminata var.zebrina

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Calcutta 4

SRA688264

SRX3946213

subsp. burmannica

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA872380

SRX5666070

subsp. microcarpa

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA872380

SRX5666071

subsp. halabanensis

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA872380

SRX5666108

subsp. truncata

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Pisang Mas

SRA880634

SRX5768721

isolate:1998-2307

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA880634

SRX5768727

isolate:2012-1154; subsp. malaccensis

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Zebrina

SRA880634

SRX5768729

isolate:2012-1173

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Paka

SRA880634

SRX5768730

isolate:2012-1156

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Green-Red

SRA880634

SRX5768731

isolate:2012-1161

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Green-Red

SRA924997

SRX6491091

isolate:2012-1161

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Zebrina

SRA924997

SRX6491094

isolate:2012-1173