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SNP , Variant , バリアント , 多型 , Oryza glaberrima , African rice , イネ アフリカ種, アフリカイネ

Oryza glaberrima
ID 集団名 解析個体
リスト
変異の
種類
参照配列 配列の種類 SNP数 データ作成者 コメント ダウンロード TASUKE+ JBrowse
Vcf
file

t4538.SNP000001

Oryza_glaberrima_SRA_100_lines_20201025

SNPs, In/dels

Oryza_glaberrima_V1

WGS

933,192

Plant GARDEN

Bwa/bcftools 1.9, (QUAL≥200, 10≤DP≤200, max-missing=0.7)