配列名:Oryza_glaberrima_V1
ゲノム配列名 | Oryza_glaberrima_V1 | 系統名 | IRGC96717 |
配列数 | 1,951 | 染色体数 | 2n = 2x = 24 |
配列長 (bp) | 316,419,574 | N50長 (bp) | 23,192,814 |
遺伝子の数 | 33,164 | 遺伝子数由来ファイル | Oryza_glaberrima.Oryza_glaberrima_V1.pep.all.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 33,164 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | 454 | 取得した配列量 | 30x |
アセンブリ方法 | NA | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 411 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | International Rice Germplasm Collection (IRGC) accession #96717, var. CG14 |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Rod A Wing (University of Arizona), Mingsheng Chen (Chinese Academy of Sciences), Klaus F X Mayer (Helmholtz Center Munich), Mingsheng Chen (Chinese Academy of Sciences) | データソース名 | Ensembl |
論文 (DOIコード) | 10.1038/ng.3044 | データソースURL | http://plants.ensembl.org/index.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:88.4%[S:86.0%,D:2.4%],F:2.1%,M:9.5%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:84.7%[S:79.2%,D:5.5%],F:4.1%,M:11.2%,n:1614 |