Oryza glaberrima| ゲノム配列名 | Bio Sample | アセンブリレベル | アノテーション (gff / gff3) |
遺伝子 (cds / gene) |
Hayai Annotation ZEN |
トランスクリプト (cDNA / mRNA) |
タンパク (pep / aa) |
ダウンロード | JBrowse | コメント |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
IRGC96717 |
Chromosome |
● |
● |
● |
● |
● |
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International Rice Germplasm Collection (IRGC) accession #96717, var. CG14 |
配列の種類 |
Bio Sample | 配列名 | Accession | JBrowse | コメント | |||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Oryza_glaberrima_V1 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Maro Tiede |
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strain:C0492 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
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strain:IRGC103777 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
IRGC104038 |
|
strain:IRGC104038 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CG 14 |
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sample_name:CG 14 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Tog 7299 |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Tog 7149 |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Tog 7153 |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Tog 7357 |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Tog 7172 |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Tog 7176 |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Tog 7325 |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Tog 7183 |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Marori |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Tog 7275 |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Adankaru |
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ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Bah |
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ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Sokpong |
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ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Sokpong (large panicle) |
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ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Gbagai (Kelei) |
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ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Makassa |
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ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Essaniouniaye |
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ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Lola coyo (G) |
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ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Mane mousso ou assaniouniaye |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Combo tuonkoun |
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ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Baladiango |
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ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Mano muosso |
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ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Malou nfouma (G) |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Samodje 2 |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
NG77E-17 |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Ex danbatta |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Gindah |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Pedikum |
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ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Ex pende kailahun |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Genekoi |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Sali 1 (Black husk) |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Gbessama 2 |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Gbalan katan |
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ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Ex jalingo |
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ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
BG 71 |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
BG 76 |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
N'konto |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Malo rans |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Baladian |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Kerkimbel |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
N'Konto |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Manhan |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
M'mleu waha |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Cuisson 2 |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
TG 34 |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Gbaigai |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Danki |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Samande |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Milauge |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Koutou baly |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Koutoun kasa |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Saali bandje |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Melange |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Saali |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Ex Santrokof kpandu |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Gbetui 2 |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Sinyarue |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Tog 12446 |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Kyanga |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Ex wurno |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Mala |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Gbensema |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CG 9 (2) |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CG 86 (3) |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Ex toussiana |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Balaole |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Molole |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Tongbon |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Salifore |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Bindje fore |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Saali |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Millcciv blanc |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Lunduko sondu |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Shawhon |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Gbeke 1 (late) |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Que |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Dissi pala |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Pa salkuta |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Konowobo |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Ewe molu |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Bouroum bouroum |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Ipando |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Morible founzan |
|
ecotyp:traditional cultivar/landrace |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PI450237 |
|
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PI450396 |
|
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PI450453 |
|
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CG 14 |
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isolate:OGP |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
IRGC104165 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
IRGC101049 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
IRGC103520 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
IRGC67563 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
IRGC68939 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
IRGC68976 |
|
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
IRGC75500 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
IRGC96841 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
IRGC103486 |
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