Oryza sativa| ID | 集団名 | 解析個体 リスト |
変異の 種類 |
参照配列 | 配列の種類 | SNP数 | データ作成者 | コメント | ダウンロード | TASUKE+ | JBrowse | |
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| 表 | Vcf file |
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t4530.SNP000001 |
Oryza_sativa_SRA_99_lines_20191107 |
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SNPs, In/dels |
WGS |
3,904,077 | Plant GARDEN |
Bwa/bcftools 1.9, (QUAL≥200, 10≤DP≤200, max-missing=0.7) |
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t4530.SNP000002 |
Oryza_rufipogon_NBRP_43_lines_20210615 |
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SNPs, In/dels |
WGS |
1,022,814 | Plant GARDEN |
DRAGEN, (QUAL≥30, 10≤DP≤100,GQ≥20, max-missing=0.7) |
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