配列名:IRGSP-1.0
ゲノム配列名 | IRGSP-1.0 | 系統名 | subsp. japonica, cv. Nipponbare |
配列数 | 63 | 染色体数 | 2n = 2x = 24 |
配列長 (bp) | 375,049,285 | N50長 (bp) | 29,958,434 |
遺伝子の数 | 42,373 | 遺伝子数由来ファイル | Oryza_sativa.IRGSP-1.0.pep.all.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 42,373 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | illumina, Roche 454 | 取得した配列量 | NA |
アセンブリ方法 | NA | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 385 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Takeshi Itoh (National Institute of Agrobiological Sciences) | データソース名 | Ensembl |
論文 (DOIコード) | 10.1186/1939-8433-6-4 | データソースURL | http://plants.ensembl.org/index.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.7%[S:96.7%,D:2.0%],F:0.9%,M:0.4%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:80.2%[S:67.3%,D:12.9%],F:9.1%,M:10.7%,n:1614 |