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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Oryza sativa subsp. japonica , Indica rice , イネ ジャポニカ亜種

Oryza sativa

Genome Assembly ID:t4530.G002

配列名:IRGSP-1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 IRGSP-1.0 系統名 subsp. japonica, cv. Nipponbare
配列数 63 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 375,049,285 N50長 (bp) 29,958,434
遺伝子の数 42,373 遺伝子数由来ファイル Oryza_sativa.IRGSP-1.0.pep.all.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 42,373 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 illumina, Roche 454 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 NA 推定ゲノムサイズ (Mb) 385
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Takeshi Itoh (National Institute of Agrobiological Sciences) データソース名 Ensembl
論文 (DOIコード) 10.1186/1939-8433-6-4 データソースURL http://plants.ensembl.org/index.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.7%[S:96.7%,D:2.0%],F:0.9%,M:0.4%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:80.2%[S:67.3%,D:12.9%],F:9.1%,M:10.7%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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