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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Olea europaea var. sylvestris , Olive, Wild olive (var. sylvestris) , オリーブ野生種 (sylvestris変種)

Olea europaea

Genome Assembly ID:t4146.G001

配列名:Oeuropaea_451_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Oeuropaea_451_v1.0 系統名 var. sylvestris
配列数 41,256 染色体数 2n = 2x = 46
配列長 (bp) 1,142,316,613 N50長 (bp) 12,567,911
遺伝子の数 50,684 遺伝子数由来ファイル Oeuropaea_451_v1.0.protein.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 50,684 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 220x
アセンブリ方法 SOAPdenovo v. 2 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,380
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Turgay Unver (Dokuz Eylul University), Marc Van Montagu (Ghent University), Yves Van de Peer (ditto) データソース名 Phytozome
論文 (DOIコード) 10.1073/pnas.1708621114 データソースURL https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:86.0%[S:75.7%,D:10.3%],F:6.6%,M:7.4%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:74.8%[S:66.1%,D:8.7%],F:9.2%,M:16.0%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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