配列名:Oeuropaea_451_v1.0
ゲノム配列名 | Oeuropaea_451_v1.0 | 系統名 | var. sylvestris |
配列数 | 41,256 | 染色体数 | 2n = 2x = 46 |
配列長 (bp) | 1,142,316,613 | N50長 (bp) | 12,567,911 |
遺伝子の数 | 50,684 | 遺伝子数由来ファイル | Oeuropaea_451_v1.0.protein.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 50,684 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 220x |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo v. 2 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,380 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Turgay Unver (Dokuz Eylul University), Marc Van Montagu (Ghent University), Yves Van de Peer (ditto) | データソース名 | Phytozome |
論文 (DOIコード) | 10.1073/pnas.1708621114 | データソースURL | https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:86.0%[S:75.7%,D:10.3%],F:6.6%,M:7.4%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:74.8%[S:66.1%,D:8.7%],F:9.2%,M:16.0%,n:1614 |