Olea europaea| ゲノム配列名 | Bio Sample | アセンブリレベル | アノテーション (gff / gff3) |
遺伝子 (cds / gene) |
Hayai Annotation ZEN |
トランスクリプト (cDNA / mRNA) |
タンパク (pep / aa) |
ダウンロード | JBrowse | コメント |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
var. sylvestris |
Chromosome |
● |
● |
● |
● |
● |
|
|
NA |
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var. europaea, cv. Farga |
Chromosome |
● |
● |
● |
● |
|
NA |
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cv. Arbequina |
Chromosome |
● |
● |
● |
● |
|
Combined Wtdgb+SMARTdenovo+Canu assembly |
配列の種類 |
Bio Sample | 配列名 | Accession | JBrowse | コメント | |||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Oeuropaea_451_v1.0 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Farga |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Farga |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Farga |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Farga |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Farga |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Farga |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Farga |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Farga |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Farga |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Farga |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Farga |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Farga |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Farga |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Farga |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Farga |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Farga |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Farga |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Farga |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Farga |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Leccino |
|
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Leccino |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Adjelella 10 |
|
subsp. laperrinei; isolate:Adjelella 10 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Oeiras 1 |
|
subsp. europaea; isolate:Oeiras 1 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Vallee du Fango 5 |
|
subsp. europaea; isolate:Vallee du Fango 5 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Barnea |
|
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Manzanillo |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Frantoio |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Morrut |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Zarza |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Picual |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Kalamon |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Hojiblanca |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Manzanillera de Huercal Overa |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Leccino |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Wild01 |
|
subsp. europaea var. sylvestris |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Wild02 |
|
subsp. europaea var. sylvestris |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Chemlal de Kabylie |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Arbequina |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Verdial de Velez-Malaga-1 |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Abou Kanani |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Ocal |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Lechin de Sevilla |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Uslu |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Manzanilla de Sevilla |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Koroneiki |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Menya |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Temprano |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Maarri |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Picudo |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Majhol-152 |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Jabali |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Dokkar |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Wild05 |
|
subsp. europaea var. sylvestris |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Forastera de Tortosa |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Wild06 |
|
subsp. europaea var. sylvestris |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Abou Satl Mohazam |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Fishomi |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Abbadi Abou Gabra-842 |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Mastoidis |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Majhol-1013 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Barnea |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Llumeta |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Wild03 |
|
subsp. europaea var. sylvestris |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Royal |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Wild04 |
|
subsp. europaea var. sylvestris |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Mavreya |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Pinonera |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Lianolia Kerkyras |
|
subsp. europaea |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Mari |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Wild08 |
|
subsp. europaea var. sylvestris |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Wild09 |
|
subsp. europaea var. sylvestris |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Wild11 |
|
subsp. europaea var. sylvestris |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Grappolo |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Barri |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Klon-14-1812 |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Myrtolia |
|
subsp. europaea |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Wild07 |
|
subsp. europaea var. sylvestris |
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