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Capsicum annuum

ゲノム配列名:Capsicum.annuum.L_Zunla-1_Release_2.0

遺伝子ファイル名:Capsicum.annuum.L_Zunla-1_v2.0_PEP.fa.gz

遺伝子配列の詳細

物理上の位置 遺伝子名 CDS
Capana07g002465
PEP
Capana07g002465
ゲノム配列上の位置 染色体 Chr07
開始位置 221038334
終了位置 221048557
配列の向き +
アノテーション情報
(Hayai Annotation ZEN)
KusakiDB KusakiDB Accession
KUNI04630140
KusakiDB バージョン 2
参照DBにおける蛋白質/転写産物配列の有無 Yes
DB間における配列の共通性
orthodb-refseq-uniprot
OrthoDB DBのバージョン 10.1
配列の説明
Protein kinase domain
Gene ID
Ortholog group unique ID
Functional annotation 出典元のDB
trembl
蛋白質名
Non-specific serine/threonine protein kinase
Accession
Uniprotアクセッションに対応するRefseqアクセッション
NA
EC
KEGG エントリー
NA
KO ID
NA
Pfam ID
PF13855,PF07714,PF11721
Pfam の詳細 詳細
InterPro ID
IPR001611,IPR011009,IPR001245,IPR008271,IPR021720,IPR000719,IPR032675
InterPro の詳細 詳細
GO ID
GO:0046777,GO:0005524,GO:0005886,GO:0004674,GO:0016021
GO の詳細 詳細
GOslim ID
GO:0016020,GO:0006793,GO:0006464,GO:0000166,GO:0016740,GO:0043167
GO slim の詳細 詳細
Transcription Factor (TF) family 
NA
TF family の詳細
NA
Best hit taxonomy Solanum lycopersicum
Solanaceae
Streptophyta
上界 Eukaryota
コメント
gene , 遺伝子 , var. annuum, cv. Zunla-1 , Solanaceae , ナス科 , Capsicum , トウガラシ属 , Chilli pepper (annuum), Wild chili pepper (glabriusculum), Chiltepin , トウガラシ (annuum変種), トウガラシ野生種 (glabriusculum変種) Chilli pepper (annuum) , トウガラシ (annuum変種)

アノテーションの詳細

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