BLAST実行

TimeStamp: 2024-11-25 00:28:26

Avena atlantica

プログラムを選択して下さい

BLASTN（核酸配列DB に対する核酸配列の検索）

BLASTP（タンパク配列DBに対するタンパク配列の検索）

BLASTX（タンパク配列DBに対する翻訳核酸配列の検索）

TBLASTN（翻訳核酸配列DBに対するタンパク配列の検索）

TBLASTX（翻訳核酸配列DBに対する翻訳核酸配列の検索）

対象とする配列を選んでください

種名

検索

消去

全て選択

検索する配列を入力してください

（FASTA形式を推奨）

Multiple FASTA配列を入力できます。ページ下部にある『高速な結果表示』のチェックを入れると、複数の配列が一度に検索されます。外すと、最初の配列のみが検索対象となります。

表示する検索結果の件数（オプション）

検索結果最大

配列のアライメント最大

その他の設定（オプション）

問い合わせ配列のフィルタリング（BLASTNではDUST, その他はSEG）

ギャップアライメントを実行しない

期待値(E-value)

1e-10

高速な結果表示

『高速な結果表示』チェックあり→結果：テキスト形式, Multiple FASTAの入力：有効 (複数の配列の検索機能を提供)
『高速な結果表示』チェックなし→結果：GUI形式(ヒット遺伝子配列をFASTAファイルとして一括で取得する機能を提供), Multiple FASTAの入力：無効(最初の配列の検索機能を提供)