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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Portulaca amilis , Paraguayan purslane , Portulaca amilis

Portulaca amilis

Genome Assembly ID:t996330.G001

配列名:Pamilis_692_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Pamilis_692_v1.0 系統名 NA
配列数 4,053 染色体数 NA
配列長 (bp) 403,885,173 N50長 (bp) 42,597,560
遺伝子の数 52,037 遺伝子数由来ファイル Pamilis_692_v1.0.protein_primaryTranscriptOnly.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, Hi-C 取得した配列量 169.1x
アセンブリ方法 Meraculous 2, HiRise v2.1.6-072ca03871cc 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Ian S Gilman (Yale University) データソース名 Phytozome
論文 (DOIコード) 10.1093/plphys/kiac116 データソースURL https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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