Schrenkiella parvula配列名：Sparvula_genome_v2.0
| ゲノム配列名 | Sparvula_genome_v2.0 | 系統名 | NA |
| 配列数 | 928 | 染色体数 | 2n = 2x = 14 |
| 配列長 (bp) | 120,016,289 | N50長 (bp) | 6,763,654 |
| 遺伝子の数 | 26,847 | 遺伝子数由来ファイル | Sparvula_574_v2.2.protein.fa |
| Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 26,847 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
| シーケンシングの方法 | Illumina, 454 | 取得した配列量 | 6x |
| アセンブリ方法 | Newbler v. 2.5, ABySS v. 1.2.1, minimus2 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 140 |
| シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | The seeds were derived from a single plant propagated from single seeds over eight successive generations. The original accession was collected from a salt lake in Tuz Golu, central Turkey, at an elevation of 905 m above sea level.This Version has been created by further removing redundant contig and used as the reference S. parvula genome in multiple comparative genomic studies since 2013 (Haudry et al., 2013; Oh et al., 2014; Oh & Dassanayake, 2019). Synonym: Thellungiella parvula, Eutrema parvulum |
| 論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
| 責任著者 | Maheshi Dassanayake (University of Illinois at Urbana-Champaign), Dong-Ha Oh (ditto), Dae-Jin Yun (Gyeongsang National University) | データソース名 | Dassanayake Lab Comparative Functional Evolutionary Genomics |
| 論文 (DOIコード) | 10.1038/ng.889 | データソースURL | https://www.lsugenomics.org/resources |
| BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
| BUSCO ゲノム | C:98.3%[S:97.3%,D:1.0%],F:0.7%,M:1.0%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:96.1%[S:93.6%,D:2.5%],F:2.0%,M:1.9%,n:1614 |
