配列名:ValleyOak3.2
ゲノム配列名 | ValleyOak3.2 | 系統名 | SW786 |
配列数 | 2,002 | 染色体数 | 2n = 2x = 24 |
配列長 (bp) | 845,947,251 | N50長 (bp) | 66,423,012 |
遺伝子の数 | 53,226 | 遺伝子数由来ファイル | GCF_001633185.2_ValleyOak3.2_protein.faa.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio RS II, Hi-C | 取得した配列量 | 80x |
アセンブリ方法 | MaSuRCA 3.2.1, HiRise | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 730 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Victoria L. Sork (University of California Los Angeles) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41467-022-29584-y | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |