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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Quercus lobata , Valley oak , オーク (lobata種)

Quercus lobata

Genome Assembly ID:t97700.G001

配列名:ValleyOak3.2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ValleyOak3.2 系統名 SW786
配列数 2,002 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 845,947,251 N50長 (bp) 66,423,012
遺伝子の数 53,226 遺伝子数由来ファイル GCF_001633185.2_ValleyOak3.2_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio RS II, Hi-C 取得した配列量 80x
アセンブリ方法 MaSuRCA 3.2.1, HiRise 推定ゲノムサイズ (Mb) 730
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Victoria L. Sork (University of California Los Angeles) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-022-29584-y データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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