Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Trifolium alexandrinum , Egyptian clover, Berseem clover , エジプシャンクローバー

Trifolium alexandrinum

Genome Assembly ID:t97006.G001

配列名:TalH_r1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 TalH_r1.0 系統名 Helaly
配列数 8 染色体数 2n = 2x = 16
配列長 (bp) 504,434,753 N50長 (bp) 55,867,553
遺伝子の数 39,945 遺伝子数由来ファイル TalH1.0_helixer.pmol.pep.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 39,945 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Hifi, GAP-Seq 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 Hifiasm 推定ゲノムサイズ (Mb) 486
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Mitsuhiko P. Sato (Kazusa DNA Res Inst) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1101/2024.07.04.602140 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット