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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Vitis riparia , Riverbank grape, Frost grape , ブドウ野生種 (riparia種)

Vitis riparia

Genome Assembly ID:t96939.G001

配列名:EGFV_Vit.rip_1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 EGFV_Vit.rip_1.0 系統名 Riparia Gloire de Montpellier
配列数 175 染色体数 2n = 2x = 38
配列長 (bp) 500,266,779 N50長 (bp) 23,918,791
遺伝子の数 39,906 遺伝子数由来ファイル GCF_004353265.1_EGFV_Vit.rip_1.0_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina HiSeq; PacBio RSII; 10X Chromium 取得した配列量 335.0x
アセンブリ方法 FALCON-Unzip v. v0.3.0; Supernova v. v2.1.0 推定ゲノムサイズ (Mb) 495
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Pierre-Francois Bert (Bordeaux University) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/s41597-019-0133-3 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.6%[S:93.9%,D:3.7%],F:1.4%,M:1.0%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.2%[S:60.8%,D:38.4%],F:0.2%,M:0.6%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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