配列名:EGFV_Vit.rip_1.0
ゲノム配列名 | EGFV_Vit.rip_1.0 | 系統名 | Riparia Gloire de Montpellier |
配列数 | 175 | 染色体数 | 2n = 2x = 38 |
配列長 (bp) | 500,266,779 | N50長 (bp) | 23,918,791 |
遺伝子の数 | 39,906 | 遺伝子数由来ファイル | GCF_004353265.1_EGFV_Vit.rip_1.0_protein.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina HiSeq; PacBio RSII; 10X Chromium | 取得した配列量 | 335.0x |
アセンブリ方法 | FALCON-Unzip v. v0.3.0; Supernova v. v2.1.0 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 495 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Pierre-Francois Bert (Bordeaux University) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41597-019-0133-3 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.6%[S:93.9%,D:3.7%],F:1.4%,M:1.0%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:99.2%[S:60.8%,D:38.4%],F:0.2%,M:0.6%,n:1614 |