配列名:Zo_v1.1
ゲノム配列名 | Zo_v1.1 | 系統名 | Zhangliang |
配列数 | 211 | 染色体数 | 2n = 2x = 22 |
配列長 (bp) | 3,090,429,014 | N50長 (bp) | 141,269,392 |
遺伝子の数 | 101,860 | 遺伝子数由来ファイル | GCF_018446385.1_Zo_v1.1_protein.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio; Illumina HiSeq; Hi-C | 取得した配列量 | 179.8x(PacBio), 232.4x(Illumina) |
アセンブリ方法 | Falcon v0.3.0, BWA-MEM, Juicer v1.5, 3D-DNA | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,593 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Yong Zou(Chongqing University of Arts and Sciences), Jianbo Jian(BGI-Shenzhen), Qingyou Xia(Southwest University), Yiqing Liu(Yangtze University) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41438-021-00627-7 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.5%[S:6.9%,D:91.6%],F:0.7%,M:0.8%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:99.0%[S:5.0%,D:94.0%],F:0.3%,M:0.7%,n:1614 |