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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Zingiber officinale , Ginger , ショウガ

Zingiber officinale

Genome Assembly ID:t94328.G001

配列名:Zo_v1.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Zo_v1.1 系統名 Zhangliang
配列数 211 染色体数 2n = 2x = 22
配列長 (bp) 3,090,429,014 N50長 (bp) 141,269,392
遺伝子の数 101,860 遺伝子数由来ファイル GCF_018446385.1_Zo_v1.1_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio; Illumina HiSeq; Hi-C 取得した配列量 179.8x(PacBio), 232.4x(Illumina)
アセンブリ方法 Falcon v0.3.0, BWA-MEM, Juicer v1.5, 3D-DNA 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,593
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Yong Zou(Chongqing University of Arts and Sciences), Jianbo Jian(BGI-Shenzhen), Qingyou Xia(Southwest University), Yiqing Liu(Yangtze University) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/s41438-021-00627-7 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.5%[S:6.9%,D:91.6%],F:0.7%,M:0.8%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.0%[S:5.0%,D:94.0%],F:0.3%,M:0.7%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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