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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Gastrodia elata , Tianma , オニノヤガラ

Gastrodia elata

Genome Assembly ID:t91201.G002

配列名:GWHBDNU00000000

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHBDNU00000000 系統名 accession No. 1345284
配列数 39 染色体数 2n = 36
配列長 (bp) 1,036,742,279 N50長 (bp) 51,759,935
遺伝子の数 33,561 遺伝子数由来ファイル GWHBDNU00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 33,561 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel II, Hi-C 取得した配列量 122x
アセンブリ方法 CANU v1.9, 3D-DNA 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,092
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jianqiang Wu (Chinese Academy of Sciences) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1111/tpj.15528 データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:75.8%[S:74.3%,D:1.5%],F:3.0%,M:21.2%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:75.9%[S:39.2%,D:36.7%],F:1.9%,M:22.2%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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