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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Camelina sativa , False flax , ナガミノアマナズナ

Camelina sativa

Genome Assembly ID:t90675.G001

配列名:Cs

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Cs 系統名 DH55
配列数 37,212 染色体数 2n = 2x = 40
配列長 (bp) 641,356,059 N50長 (bp) 30,099,736
遺伝子の数 107,481 遺伝子数由来ファイル GCF_000633955.1_Cs_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 107,481 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, 454 取得した配列量 100.0x
アセンブリ方法 SOAPdenovo v. 2.01 推定ゲノムサイズ (Mb) 750
シーケンシングの方法のコメント NA コメント A homozygous doubled haploid line and derived from C. sativa genotype SRS 933.
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Andrew G. Sharpe (National Research Council Canada), Isobel A.P. Parkin (Agriculture and Agri-Food Canada) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/ncomms4706 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.4%[S:3.6%,D:95.8%],F:0.3%,M:0.3%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.6%[S:1.3%,D:98.3%],F:0.2%,M:0.2%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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