配列名:Cs
ゲノム配列名 | Cs | 系統名 | DH55 |
配列数 | 37,212 | 染色体数 | 2n = 2x = 40 |
配列長 (bp) | 641,356,059 | N50長 (bp) | 30,099,736 |
遺伝子の数 | 107,481 | 遺伝子数由来ファイル | GCF_000633955.1_Cs_protein.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 107,481 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, 454 | 取得した配列量 | 100.0x |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo v. 2.01 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 750 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | A homozygous doubled haploid line and derived from C. sativa genotype SRS 933. |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Andrew G. Sharpe (National Research Council Canada), Isobel A.P. Parkin (Agriculture and Agri-Food Canada) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1038/ncomms4706 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.4%[S:3.6%,D:95.8%],F:0.3%,M:0.3%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:99.6%[S:1.3%,D:98.3%],F:0.2%,M:0.2%,n:1614 |