Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Arctostaphylos glauca , Big Berry Manzanita , マンザニータ

Arctostaphylos glauca

Genome Assembly ID:t89197.G001

配列名:GCA_019985065.2_ddArcGlau1.1p_genomic

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GCA_019985065.2_ddArcGlau1.1p_genomic 系統名 wild accession
配列数 272 染色体数 2n=2x=26or2n=4x=48
配列長 (bp) 547,665,946 N50長 (bp) 31,280,058
遺伝子の数 0 遺伝子数由来ファイル NA
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Hi-C, PacBio 取得した配列量 199 million read pairs(Hi-C), 45x(PacBio)
アセンブリ方法 HiFiasm [Version 0.13-r308] 推定ゲノムサイズ (Mb) 600
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Amy Litt (University of California) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1093/jhered/esab071 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット