配列名:Cclementina_182_v1
ゲノム配列名 | Cclementina_182_v1 | 系統名 | cv. Clemenules |
配列数 | 1,398 | 染色体数 | 2n = 2x = 18 |
配列長 (bp) | 301,386,998 | N50長 (bp) | 31,410,901 |
遺伝子の数 | 24,533 | 遺伝子数由来ファイル | Cclementina_182_v1.0.protein_primaryTranscriptOnly.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 24,533 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Sanger | 取得した配列量 | 6.97x |
アセンブリ方法 | Arachne v.200710161 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 370 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | An induced haploid plant C. x clementina 'Clemenules' |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Daniel Rokhsar (U.S. Department of Energy (DOE) Joint Genome Institute (JGI)); Frederick Gmitter (University of Florida) | データソース名 | Phytozome |
論文 (DOIコード) | 10.1038/nbt.2906 | データソースURL | https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.3%[S:97.6%,D:0.7%],F:1.2%,M:0.5%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:95.5%[S:94.3%,D:1.2%],F:3.1%,M:1.4%,n:1614 |