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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Citrus clementina , Clementine , クレメンティン, クレメンタイン

Citrus clementina

Genome Assembly ID:t85681.G001

配列名:Cclementina_182_v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Cclementina_182_v1 系統名 cv. Clemenules
配列数 1,398 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 301,386,998 N50長 (bp) 31,410,901
遺伝子の数 24,533 遺伝子数由来ファイル Cclementina_182_v1.0.protein_primaryTranscriptOnly.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 24,533 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Sanger 取得した配列量 6.97x
アセンブリ方法 Arachne v.200710161 推定ゲノムサイズ (Mb) 370
シーケンシングの方法のコメント NA コメント An induced haploid plant C. x clementina 'Clemenules'
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Daniel Rokhsar (U.S. Department of Energy (DOE) Joint Genome Institute (JGI)); Frederick Gmitter (University of Florida) データソース名 Phytozome
論文 (DOIコード) 10.1038/nbt.2906 データソースURL https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.3%[S:97.6%,D:0.7%],F:1.2%,M:0.5%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:95.5%[S:94.3%,D:1.2%],F:3.1%,M:1.4%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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