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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Aralia elata , Japanese angelica tree , タラノキ

Aralia elata

Genome Assembly ID:t82095.G001

配列名:AE

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 AE 系統名 NA
配列数 27 染色体数 2n = 24
配列長 (bp) 1,047,181,497 N50長 (bp) 85,555,957
遺伝子の数 35,042 遺伝子数由来ファイル AE.maker.final.chrom_level.gene.pep.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel II, Hi-C 取得した配列量 90.6x
アセンブリ方法 Canu v2.1 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,080
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Yuhua Li (Northeast Forestry University) データソース名 DRYAD
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-022-29908-y データソースURL https://datadryad.org
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.9%[S:85.2%,D:13.7%],F:0.9%,M:0.2%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:97.1%[S:85.7%,D:11.5%],F:1.5%,M:1.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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