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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Capsicum chinense , Bonnet pepper , トウガラシ (chinense種)

Capsicum chinense

Genome Assembly ID:t80379.G002

配列名:Chinense.v.1.2.scaffold

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Chinense.v.1.2.scaffold 系統名 PI159236
配列数 51,917 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 3,009,228,238 N50長 (bp) 3,291,717
遺伝子の数 35,009 遺伝子数由来ファイル Chinense.v.1.2.PEP.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 119.8x
アセンブリ方法 SOAPdenovo, SSPACE 推定ゲノムサイズ (Mb) 3,140
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Doil Choi (Seoul National University) データソース名 Pepper Genome Platform
論文 (DOIコード) 10.1038/ng.2877 データソースURL http://peppergenome.snu.ac.kr
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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