配列名:ASM227189v2
ゲノム配列名 | ASM227189v2 | 系統名 | isolate PI159236 |
配列数 | 87,978 | 染色体数 | 2n = 2x = 24 |
配列長 (bp) | 3,070,910,353 | N50長 (bp) | 234,238,532 |
遺伝子の数 | 34,974 | 遺伝子数由来ファイル | GCA_002271895.2_ASM227189v2_protein.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 34,974 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 132.2x |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo v. 2.04-r240; SSPACE v. 2.0; Platanus v. 1.2.1 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 3,200 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Doil Choi (Seoul National University) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1186/s13059-017-1341-9 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.9%[S:95.9%,D:2.0%],F:1.3%,M:0.8%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:80.0%[S:78.3%,D:1.7%],F:8.6%,M:11.4%,n:1614 |