Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Amorphophallus konjac , Perennial herb , コンニャク

Amorphophallus konjac

Genome Assembly ID:t78372.G001

配列名:GCA_022559845.1_ASM2255984v1_genomic

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GCA_022559845.1_ASM2255984v1_genomic 系統名 wild accession
配列数 3,678 染色体数 2n = 2x = 26
配列長 (bp) 5,598,555,559 N50長 (bp) 419,331,422
遺伝子の数 44,332 遺伝子数由来ファイル Amorphophallus_konjac.clean.pep.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina(short-read, 10X Genomics), PacBio, Hi-C 取得した配列量 118x(Short-read), 101x(PacBio), 83x(10x Genomics)
アセンブリ方法 FALCON 推定ゲノムサイズ (Mb) 5,670
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Lizhou Tang (Jiangxi Normal University) データソース名 NCBI; Figshare
論文 (DOIコード) 10.1016/j.csbj.2022.02.009 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
https://doi.org/10.6084/m9.figshare.15169578
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット