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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Salix purpurea , Purple osier , セイヨウコリヤナギ

Salix purpurea

Genome Assembly ID:t77065.G001

配列名:Spurpurea_519_v5.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Spurpurea_519_v5.1 系統名 female clone 94006
配列数 348 染色体数 2n = 2x = 38
配列長 (bp) 329,287,719 N50長 (bp) 14,688,223
遺伝子の数 35,125 遺伝子数由来ファイル Spurpurea_519_v5.1.protein_primaryTranscriptOnly.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio RSII 取得した配列量 110x
アセンブリ方法 FALCON-UNZIP 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Stephen P. DiFazio (West Virginia University) データソース名 Phytozome
論文 (DOIコード) 10.1186/s13059-020-1952-4 データソースURL https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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