Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Eucalyptus urophylla x Eucalyptus grandis , Eucalyptus urophylla x Eucalyptus grandis , ユーカリ交雑種

Eucalyptus urophylla x Eucalyptus grandis

Genome Assembly ID:t765255.G001

配列名:E.urophyllaxE.grandis

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 E.urophyllaxE.grandis 系統名 NA
配列数 209 染色体数 NA
配列長 (bp) 545,748,243 N50長 (bp) 51,620,406
遺伝子の数 0 遺伝子数由来ファイル NA
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio, Hi-C 取得した配列量 142.31x (Illumina), 51.29x (PacBio), 108.05x (Hi-C)
アセンブリ方法 Hifiasm, Juicer v.1.5, 3D-DNA 推定ゲノムサイズ (Mb) 549
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Lejun Ouyang (Guangdong University of Petrochemical Technology) データソース名 Figshare
論文 (DOIコード) 10.1186/s12864-023-09318-0 データソースURL https://figshare.com
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット