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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Rubus occidentalis , black raspberry , クロミキイチゴ, クロラズベリー

Rubus occidentalis

Genome Assembly ID:t75079.G001

配列名:Rubus occidentalis v3.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Rubus occidentalis v3.0 系統名 ORUS4115-3
配列数 7 染色体数 2n = 2x = 14
配列長 (bp) 290,824,797 N50長 (bp) 41,098,493
遺伝子の数 33,286 遺伝子数由来ファイル Rubus_occ_V3.proteins.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio 取得した配列量 76x
アセンブリ方法 Canu V1.4 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Robert VanBuren (Michigan State University) データソース名 GDR: Genome Database For Rosaceae
論文 (DOIコード) 10.1093/gigascience/giy094 データソースURL https://www.rosaceae.org/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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