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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Calamus simplicifolius , Danye rattan , Calamus simplicifolius

Calamus simplicifolius

Genome Assembly ID:t746888.G001

配列名:C.simplicifolius.WGS

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 C.simplicifolius.WGS 系統名 NA
配列数 5,116 染色体数 NA
配列長 (bp) 1,960,809,755 N50長 (bp) 803,014
遺伝子の数 51,235 遺伝子数由来ファイル C.simplicifolius.coding.gene.pep.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio Sequel, Hi-C 取得した配列量 252x
アセンブリ方法 Platanus v1.2.4, DBG2OLC 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,980
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Hybrid de novo genome assembly
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Zehui Jiang (International Center for Bamboo and Rattan) データソース名 GIGA DB
論文 (DOIコード) 10.1093/gigascience/giy097 データソースURL http://gigadb.org/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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