配列名:RchiOBHm-V2
ゲノム配列名 | RchiOBHm-V2 | 系統名 | Old Blush |
配列数 | 53 | 染色体数 | 2n = 2x = 10 |
配列長 (bp) | 515,118,979 | N50長 (bp) | 69,643,165 |
遺伝子の数 | 48,188 | 遺伝子数由来ファイル | GCF_002994745.2_RchiOBHm-V2_protein.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio RSII; Illumina | 取得した配列量 | 80.0x |
アセンブリ方法 | TIL-R v. Rev: 523; CANU v. 1.6 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 560 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | F.Foucher (IRHS, Agrocampus-Ouest, INRA, Universite d'Angers) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41477-018-0166-1 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.8%[S:94.4%,D:4.4%],F:0.6%,M:0.6%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:99.7%[S:64.4%,D:35.3%],F:0.0%,M:0.3%,n:1614 |