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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Rosa chinensis var. Old Blush , China rose (var. Old Blush) , コウシンバラ (Old Blush変種)

Rosa chinensis

Genome Assembly ID:t74649.G001

配列名:RchiOBHm-V2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 RchiOBHm-V2 系統名 Old Blush
配列数 53 染色体数 2n = 2x = 10
配列長 (bp) 515,118,979 N50長 (bp) 69,643,165
遺伝子の数 48,188 遺伝子数由来ファイル GCF_002994745.2_RchiOBHm-V2_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio RSII; Illumina 取得した配列量 80.0x
アセンブリ方法 TIL-R v. Rev: 523; CANU v. 1.6 推定ゲノムサイズ (Mb) 560
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 F.Foucher (IRHS, Agrocampus-Ouest, INRA, Universite d'Angers) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/s41477-018-0166-1 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.8%[S:94.4%,D:4.4%],F:0.6%,M:0.6%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.7%[S:64.4%,D:35.3%],F:0.0%,M:0.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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