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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Conyza canadensis , Horseweed , ヒメムカシヨモギ

Conyza canadensis

Genome Assembly ID:t72917.G001

配列名:C_canadensis_v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 C_canadensis_v1 系統名 Cc75
配列数 357 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 426,376,474 N50長 (bp) 45,539,152
遺伝子の数 34,584 遺伝子数由来ファイル GCF_010389155.1_C_canadensis_v1_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio; Illumina; Hi-C 取得した配列量 248.0x
アセンブリ方法 CANU v. 1.8; Proximo v. 2.0 推定ゲノムサイズ (Mb) 335
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 C.Neal Stewart, Jr (University of California) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1104/pp.114.247668 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.5%[S:95.6%,D:2.9%],F:0.7%,M:0.8%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.0%[S:75.5%,D:23.5%],F:0.3%,M:0.7%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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