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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Orychophragmus violaceus , Chinese violet cress , ショカツサイ

Orychophragmus violaceus

Genome Assembly ID:t71234.G001

配列名:GWHBGBQ00000000

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHBGBQ00000000 系統名 NA
配列数 177 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 1,334,224,007 N50長 (bp) 99,979,558
遺伝子の数 55,279 遺伝子数由来ファイル GWHBGBQ00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Oxford Nanopore, Hi-C 取得した配列量 164x (Oxford Nanopore), 178x (Hi-C)
アセンブリ方法 Minimap, Miniasm, Juicer, ALLHIC 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,330
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Feng Cheng (Chinese Academy of Agricultural Sciences) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1016/j.xplc.2022.100431 データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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