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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Eucalyptus grandis , Rose gum , ユーカリ (grandis種), ローズガム

Eucalyptus grandis

Genome Assembly ID:t71139.G001

配列名:Egrandis_297_v2.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Egrandis_297_v2.0 系統名 genotype BRASUZ1
配列数 4,943 染色体数 2n = 2x = 22
配列長 (bp) 691,346,258 N50長 (bp) 57,472,304
遺伝子の数 46,280 遺伝子数由来ファイル Egrandis_297_v2.0.protein.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 46,280 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 ABI 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 ARACHNE v. 20071016_HA 推定ゲノムサイズ (Mb) 640
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Alexander A. Myburg (University of Pretoria) データソース名 Phytozome
論文 (DOIコード) 10.1038/nature13308 データソースURL https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.0%[S:93.1%,D:4.9%],F:1.4%,M:0.6%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:94.0%[S:63.8%,D:30.2%],F:3.3%,M:2.7%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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