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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Medicago ruthenica , Perennial legume forage , マンシュウウマゴヤシ

Medicago ruthenica

Genome Assembly ID:t70973.G001

配列名:Mru.genome

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Mru.genome 系統名 wild accession
配列数 650 染色体数 2n = 2x = 16
配列長 (bp) 904,130,090 N50長 (bp) 99,386,155
遺伝子の数 50,162 遺伝子数由来ファイル Mru.cds.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio, Hi-C, 10X Genomics 取得した配列量 105x(PacBio), 330x(Illumina), 131x(10X Genomics), 116x(Hi-C)
アセンブリ方法 FALCON 推定ゲノムサイズ (Mb) 914
シーケンシングの方法のコメント from 270 bp and 500 bp insert size libraries(Illumina) コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Wen-Hao Zhang (The Chinese Academy of Sciences) データソース名 figshare
論文 (DOIコード) 10.1186/s12915-021-01033-0 データソースURL https://figshare.com/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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