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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Ficus microcarpa , Banyan tree, Indian laurel fig, Malay banyan, Curtain fig, Laurel fig , ガジュマル

Ficus microcarpa

Genome Assembly ID:t66385.G001

配列名:GWHABKV00000000.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHABKV00000000.1 系統名 NA
配列数 738 染色体数 2n = 26
配列長 (bp) 426,563,229 N50長 (bp) 29,290,112
遺伝子の数 29,390 遺伝子数由来ファイル GWHABKV00000000.1.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 29,390 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Pacbio RSII, Hi-C 取得した配列量 86.5x (PacBio), 76.37x (Hi-C)
アセンブリ方法 FALCON, SMARTdenovo, ALLHiC 推定ゲノムサイズ (Mb) 370
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Ray Ming (University of Illinois at Urbana-Champaign) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1016/j.cell.2020.09.043 データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.7%[S:86.1%,D:11.6%],F:1.2%,M:1.1%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:90.8%[S:80.5%,D:10.3%],F:4.9%,M:4.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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