配列名:FER_r1.1
ゲノム配列名 | FER_r1.1 | 系統名 | FE-Hiroshima-1 |
配列数 | 14 | 染色体数 | 2n = 2x = 26 |
配列長 (bp) | 336,859,726 | N50長 (bp) | 22,827,815 |
遺伝子の数 | 93,450 | 遺伝子数由来ファイル | FER_r1.1.pseudomolecule.proteins.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 93,450 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio Sequel | 取得した配列量 | 62.5x |
アセンブリ方法 | FALCON | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 341 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1111/tpj.14703 | データソースURL | https://plantgarden.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.5%[S:93.2%,D:4.3%],F:1.2%,M:1.3%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:96.5%[S:31.6%,D:64.9%],F:1.7%,M:1.8%,n:1614 |