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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Ficus erecta , Japanese fig , イヌビワ

Ficus erecta

Genome Assembly ID:t66383.G001

配列名:FER_r1.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 FER_r1.1 系統名 FE-Hiroshima-1
配列数 14 染色体数 2n = 2x = 26
配列長 (bp) 336,859,726 N50長 (bp) 22,827,815
遺伝子の数 93,450 遺伝子数由来ファイル FER_r1.1.pseudomolecule.proteins.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 93,450 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel 取得した配列量 62.5x
アセンブリ方法 FALCON 推定ゲノムサイズ (Mb) 341
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1111/tpj.14703 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.5%[S:93.2%,D:4.3%],F:1.2%,M:1.3%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:96.5%[S:31.6%,D:64.9%],F:1.7%,M:1.8%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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