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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Erianthus ravennae , Ravenna grass, Hardy pampas grass , エリアンサス野生種(ravennae種)

Erianthus ravennae

Genome Assembly ID:t65978.G001

配列名:ERA_r1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ERA_r1.0 系統名 JEr18-1
配列数 34 染色体数 2n = 2x = 10
配列長 (bp) 1,052,003,948 N50長 (bp) 96,005,621
遺伝子の数 61,078 遺伝子数由来ファイル ERA_r1.0_pep_HC.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel, Hi-C 取得した配列量
アセンブリ方法 FALCON, AllHiC 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,000
シーケンシングの方法のコメント コメント Unphased genome, Synonym: Tripidium ravennae, Saccharum ravennae, Saccharum elephantinum, Erianthus elephantinus
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Sachiko Isobe (Kazusa DNA Res Inst, University of Tokyo) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) in preparation データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.8%[S:94.2%,D:4.6%],F:0.9%,M:0.3%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:93.3%[S:89.0%,D:4.3%],F:2.5%,M:4.2%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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