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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Actinidia polygama , Silver vine , マタタビ

Actinidia polygama

Genome Assembly ID:t64480.G001

配列名:APO_r1.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 APO_r1.1 系統名 Hokkaido-male
配列数 30 染色体数 2n = 2x = 58
配列長 (bp) 620,382,890 N50長 (bp) 20,432,968
遺伝子の数 68,182 遺伝子数由来ファイル APO1.1.proteins.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 68,182 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Hifi 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 Hifiasm 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Takashi Akagi (Okayama University) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1038/s41477-023-01361-9 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.1 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.4%[S:66.8%,D:31.6%],F:0.5%,M:1.1%,n:2326 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) NA

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染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット