Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Kalanchoe fedtschenkoi , Lavender-scallops , カランコエ

Kalanchoe fedtschenkoi

Genome Assembly ID:t63787.G001

配列名:Kfedtschenkoi_382_v1.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Kfedtschenkoi_382_v1.1 系統名 M2
配列数 1,324 染色体数 2n = 2x = 34
配列長 (bp) 256,351,415 N50長 (bp) 2,451,343
遺伝子の数 30,964 遺伝子数由来ファイル Kfedtschenkoi_382_v1.1.protein_primaryTranscriptOnly.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 70x (paired-end reads), 37x (mate-pair reads)
アセンブリ方法 platanus, MeDuSa 推定ゲノムサイズ (Mb) 260
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Xiaohan Yang (University of Tennessee) データソース名 Phytozome
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-017-01491-7 データソースURL https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット