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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Chenopodium quinoa , Quinoa , キノア, キヌア

Chenopodium quinoa

Genome Assembly ID:t63459.G006

配列名:J100

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 J100 系統名 J100
配列数 813 染色体数 2n = 4x = 36
配列長 (bp) 1,319,872,862 N50長 (bp) 70,609,007
遺伝子の数 65,303 遺伝子数由来ファイル J100.cds.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 64,945 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, genetic mapping 取得した配列量 26x
アセンブリ方法 Hifiasm 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,500
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Yasunari Fujita (Japan International Research Center for Agricultural Sciences (JIRCAS)) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.3389/fpls.2024.1434388 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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