配列名:J100
ゲノム配列名 | J100 | 系統名 | J100 |
配列数 | 813 | 染色体数 | 2n = 4x = 36 |
配列長 (bp) | 1,319,872,862 | N50長 (bp) | 70,609,007 |
遺伝子の数 | 65,303 | 遺伝子数由来ファイル | J100.cds.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 64,945 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio, genetic mapping | 取得した配列量 | 26x |
アセンブリ方法 | Hifiasm | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,500 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Yasunari Fujita (Japan International Research Center for Agricultural Sciences (JIRCAS)) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.3389/fpls.2024.1434388 | データソースURL | https://plantgarden.jp/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |