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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Chenopodium quinoa , Quinoa , キノア, キヌア

Chenopodium quinoa

Genome Assembly ID:t63459.G004

配列名:Cquinoa_QQ74_v2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Cquinoa_QQ74_v2 系統名 accession PI 614886, QQ74
配列数 2,942 染色体数 2n = 4x = 36
配列長 (bp) 1,326,337,151 N50長 (bp) 66,924,138
遺伝子の数 54,685 遺伝子数由来ファイル Cquinoa_QQ74_v2_prot.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Hi-C 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 HiRise, Proximo assembler 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント To produce the quinoa QQ74 V2 assembly, in vivo Hi-C scaffolding was performed with assemblies (PacBio, PacBio+BioNano, PacBio+Chicago) based on data from the V1 assembly. コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 David E. Jarvis (Brigham Young University) データソース名 DRYAD
論文 (DOIコード) 10.1038/s42003-023-05613-4 データソースURL https://datadryad.org
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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