配列名:Cquinoa_QQ74_v2
ゲノム配列名 | Cquinoa_QQ74_v2 | 系統名 | accession PI 614886, QQ74 |
配列数 | 2,942 | 染色体数 | 2n = 4x = 36 |
配列長 (bp) | 1,326,337,151 | N50長 (bp) | 66,924,138 |
遺伝子の数 | 54,685 | 遺伝子数由来ファイル | Cquinoa_QQ74_v2_prot.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Hi-C | 取得した配列量 | NA |
アセンブリ方法 | HiRise, Proximo assembler | 推定ゲノムサイズ (Mb) | NA |
シーケンシングの方法のコメント | To produce the quinoa QQ74 V2 assembly, in vivo Hi-C scaffolding was performed with assemblies (PacBio, PacBio+BioNano, PacBio+Chicago) based on data from the V1 assembly. | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | David E. Jarvis (Brigham Young University) | データソース名 | DRYAD |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s42003-023-05613-4 | データソースURL | https://datadryad.org |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |