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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Chenopodium quinoa , Quinoa , キノア, キヌア

Chenopodium quinoa

Genome Assembly ID:t63459.G003

配列名:Cq_real_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Cq_real_v1.0 系統名 cv. Real Blanca
配列数 3,185 染色体数 2n = 4x = 36
配列長 (bp) 1,336,736,708 N50長 (bp) 1,159,391
遺伝子の数 0 遺伝子数由来ファイル NA
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio RSII, Illumina 取得した配列量 97.61x
アセンブリ方法 DISCOVAR, SSPACE 3.0, Falcon v0.3, Canu, HABOT2 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,450
シーケンシングの方法のコメント NA コメント The assemblies generated using Illumina and PacBio reads separately were merged together using the HABOT2.
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Heng Zhang (CAS Center for Excellence in Molecular Plant Sciences) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/cr.2017.124 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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