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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Chenopodium quinoa , Quinoa , キノア, キヌア

Chenopodium quinoa

Genome Assembly ID:t63459.G001

配列名:Cqu_r1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Cqu_r1.0 系統名 NA
配列数 24,845 染色体数 2n = 4x = 36
配列長 (bp) 1,087,411,675 N50長 (bp) 86,941
遺伝子の数 226,647 遺伝子数由来ファイル Cqu_r1.0.pep.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio RS II 取得した配列量 196x (Illumina), 31x (PacBio)
アセンブリ方法 ALLPATHS-LG v52488, PBJelly2 v14.1.14 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,500
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Yasunari Fujita (Japan International Research Center for Agricultural Sciences (JIRCAS)) データソース名 QGDB: Quinoa Genome DataBase
論文 (DOIコード) 10.1093/dnares/dsw037 データソースURL http://quinoa.kazusa.or.jp
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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