配列名:Cqu_r1.0
ゲノム配列名 | Cqu_r1.0 | 系統名 | NA |
配列数 | 24,845 | 染色体数 | 2n = 4x = 36 |
配列長 (bp) | 1,087,411,675 | N50長 (bp) | 86,941 |
遺伝子の数 | 226,647 | 遺伝子数由来ファイル | Cqu_r1.0.pep.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, PacBio RS II | 取得した配列量 | 196x (Illumina), 31x (PacBio) |
アセンブリ方法 | ALLPATHS-LG v52488, PBJelly2 v14.1.14 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,500 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Yasunari Fujita (Japan International Research Center for Agricultural Sciences (JIRCAS)) | データソース名 | QGDB: Quinoa Genome DataBase |
論文 (DOIコード) | 10.1093/dnares/dsw037 | データソースURL | http://quinoa.kazusa.or.jp |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |