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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Trema orientalis , Trema orientalis , ウラジロエノキ

Trema orientalis

Genome Assembly ID:t63057.G001

配列名:TorRG33x02_asm01

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 TorRG33x02_asm01 系統名 accession RG33
配列数 2,756 染色体数 NA
配列長 (bp) 387,958,189 N50長 (bp) 656,203
遺伝子の数 35,849 遺伝子数由来ファイル GCA_002914845.1_TorRG33x02_asm01_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 35,849 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 121x
アセンブリ方法 ALLPATHS-LG, SSPACE v3.0 推定ゲノムサイズ (Mb) 506
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Rene Geurts (Wageningen University) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1073/pnas.1721395115 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.5%[S:96.4%,D:2.0%],F:1.2%,M:0.3%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:92.3%[S:90.3%,D:2.0%],F:5.9%,M:1.9%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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