Saccharum spontaneum配列名：Sspon.HiC_chr_asm
| ゲノム配列名 | Sspon.HiC_chr_asm | 系統名 | AP85-441 |
| 配列数 | 32 | 染色体数 | 1n = 4x = 32 |
| 配列長 (bp) | 2,900,240,836 | N50長 (bp) | 91,445,600 |
| 遺伝子の数 | 53,284 | 遺伝子数由来ファイル | Saccharum_spontaneum.Sspon.HiC_chr_asm.pep.all.fa |
| Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 53,284 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
| シーケンシングの方法 | Illumina; PacBio RSII | 取得した配列量 | 90.0x |
| アセンブリ方法 | CANU v. May-2017; HiC v. May-2017 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 3,360 |
| シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | AP85-441 is a haploid (1n=4x=32) S. spontaneum generated from a culture of octoploid SES2086. |
| 論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
| 責任著者 | Jisen Zhang (Fujian Agriculture and Forestry University), Ray Ming (ditto), Chifumi Nagai (Hawaii Agriculture Research Center) | データソース名 | Ensembl |
| 論文 (DOIコード) | 10.1038/s41588-018-0237-2 | データソースURL | http://plants.ensembl.org/index.html |
| BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
| BUSCO ゲノム | C:98.7%[S:9.0%,D:89.7%],F:0.6%,M:0.7%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:75.9%[S:39.0%,D:36.9%],F:7.4%,M:16.7%,n:1614 |
