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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Fagopyrum tataricum , Tartary buckwheat, Kangra buckwheat , ダッタンソバ

Fagopyrum tataricum

Genome Assembly ID:t62330.G002

配列名:Fagopyrum_tataricum_hap1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Fagopyrum_tataricum_hap1 系統名 cv. Qianku3
配列数 1,986 染色体数 2n = 2x = 16
配列長 (bp) 525,965,937 N50長 (bp) 55,820,945
遺伝子の数 39,560 遺伝子数由来ファイル Fagopyrum_tataricum_hap1.prot.long.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel II, Hi-C 取得した配列量 64.58x (PacBio), 184.44x (Hi-C)
アセンブリ方法 hifiasm, Juicer v1.6.2, 3D-DNA v180922 推定ゲノムサイズ (Mb) 579
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jianquan Liu (Sichuan University) データソース名 Figshare
論文 (DOIコード) 10.1186/s12915-023-01587-1 データソースURL https://figshare.com
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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