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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Fagopyrum tataricum , Tartary buckwheat, Kangra buckwheat , ダッタンソバ

Fagopyrum tataricum

Genome Assembly ID:t62330.G001

配列名:FtChromosomeV2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 FtChromosomeV2 系統名 cv. Pinku1
配列数 8 染色体数 2n = 2x = 16
配列長 (bp) 451,328,869 N50長 (bp) 56,655,744
遺伝子の数 34,544 遺伝子数由来ファイル FtChromosomeV2.IGDBv2.Coreset.pros.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 34,544 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio 取得した配列量 200x
アセンブリ方法 Celera Assembler v. 8.3, MaSuRCA v. 3.1 推定ゲノムサイズ (Mb) 490
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jun Wang (South China Agricultural University), Lin Cui (Shanxi Academy of Agricultural Sciences), Huimin Liu (Ministry of Agriculture), Chengzhi Liang (Chinese Academy of Sciences), Zhijun Qiao (Shanxi Academy of Agricultural Sciences) データソース名 MBK BASE: Molecular Breeding Knowledgebase
論文 (DOIコード) 10.1016/j.molp.2017.08.013 データソースURL http://www.mbkbase.org/Pinku1
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:95.1%[S:91.0%,D:4.1%],F:1.7%,M:3.2%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:89.5%[S:80.4%,D:9.1%],F:4.2%,M:6.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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