配列名:FtChromosomeV2
ゲノム配列名 | FtChromosomeV2 | 系統名 | cv. Pinku1 |
配列数 | 8 | 染色体数 | 2n = 2x = 16 |
配列長 (bp) | 451,328,869 | N50長 (bp) | 56,655,744 |
遺伝子の数 | 34,544 | 遺伝子数由来ファイル | FtChromosomeV2.IGDBv2.Coreset.pros.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 34,544 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, PacBio | 取得した配列量 | 200x |
アセンブリ方法 | Celera Assembler v. 8.3, MaSuRCA v. 3.1 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 490 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Jun Wang (South China Agricultural University), Lin Cui (Shanxi Academy of Agricultural Sciences), Huimin Liu (Ministry of Agriculture), Chengzhi Liang (Chinese Academy of Sciences), Zhijun Qiao (Shanxi Academy of Agricultural Sciences) | データソース名 | MBK BASE: Molecular Breeding Knowledgebase |
論文 (DOIコード) | 10.1016/j.molp.2017.08.013 | データソースURL | http://www.mbkbase.org/Pinku1 |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:95.1%[S:91.0%,D:4.1%],F:1.7%,M:3.2%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:89.5%[S:80.4%,D:9.1%],F:4.2%,M:6.3%,n:1614 |