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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Arabidopsis lyrata , Northern rock-cress , ミヤマハタザオ

Arabidopsis lyrata

Genome Assembly ID:t59689.G001

配列名:Alyrata_384_v2.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Alyrata_384_v2.1 系統名 MN47
配列数 695 染色体数 2n = 2x = 16
配列長 (bp) 206,667,935 N50長 (bp) 24,464,547
遺伝子の数 31,073 遺伝子数由来ファイル Alyrata_384_v2.1.protein_primaryTranscriptOnly.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina HiSeq 取得した配列量 8.3x
アセンブリ方法 Arachne v.20071016 推定ゲノムサイズ (Mb) 206
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Ya-Long Guo (Max Planck Institute for Developmental Biology) データソース名 Phytozome
論文 (DOIコード) 10.1038/ng.807 データソースURL https://phytozome-next.jgi.doe.gov/info/Alyrata_v2_1
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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