配列名:V1.0
ゲノム配列名 | V1.0 | 系統名 | RM-CF-00679 (BM 19/20) |
配列数 | 390 | 染色体数 | 2n = 2x = 22 |
配列長 (bp) | 420,721,971 | N50長 (bp) | 29,629,744 |
遺伝子の数 | 32,874 | 遺伝子数由来ファイル | mRNA_Cohum_active_pep_20200923.tfa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio RSCll 63 SMRT cell, Illumina Hiseq2500 | 取得した配列量 | 102x |
アセンブリ方法 | FALCON assembler | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 422 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Romain Guyot (Universidad Autonoma de Manizales), Dominique Crouzillat (Nestle Research-Plant Science Research Unit) | データソース名 | Sol Genomics Network |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41598-021-87419-0 | データソースURL | https://solgenomics.net/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:95.3%[S:93.9%,D:1.4%],F:2.2%,M:2.5%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:77.3%[S:75.6%,D:1.7%],F:11.9%,M:10.8%,n:1614 |