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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Zizania latifolia , Chinese wild rice, Jiaobai, Water bamboo , マコモ, マコモダケ

Zizania latifolia

Genome Assembly ID:t58934.G001

配列名:GWHBFHI00000000

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHBFHI00000000 系統名 acc. Huai'an
配列数 164 染色体数 2n = 2x = 34
配列長 (bp) 547,397,560 N50長 (bp) 32,785,325
遺伝子の数 38,789 遺伝子数由来ファイル GWHBFHI00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 38,789 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Oxford Nanopore 取得した配列量 112.46x
アセンブリ方法 SMARTdenovo 推定ゲノムサイズ (Mb) 606
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Ning Yan (Tobacco Research Institute of Chinese Academy of Agricultural Sciences) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1038/s42003-021-02993-3 データソースURL https://ngdc.cncb.ac.cn/gwh
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.0%[S:73.0%,D:26.0%],F:0.9%,M:0.1%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:98.2%[S:73.5%,D:24.7%],F:0.8%,M:1.0%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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