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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Paulownia fortunei , Princess trees, Empress trees , ココノエギリ

Paulownia fortunei

Genome Assembly ID:t586722.G001

配列名:GCA_018127125.1_RGv1.1_genomic

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GCA_018127125.1_RGv1.1_genomic 系統名 wild accession
配列数 1,677 染色体数 2n = 40
配列長 (bp) 511,771,795 N50長 (bp) 22,146,478
遺伝子の数 31,673 遺伝子数由来ファイル GCA_019321725.1_Paulownia_fortunei_Genome_V1.0_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, Illumina, Hi-C 取得した配列量 90x(Hi-C), 87.3x(PacBio), 89x(Illumina)
アセンブリ方法 WTDBG (v.1.2.8) 推定ゲノムサイズ (Mb) 552(k-mer), 528.4(flow cytometry)
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Guoqiang Fan (Henan Agricultural University) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1016/j.molp.2021.06.021 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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