配列名:GCA_018127125.1_RGv1.1_genomic
ゲノム配列名 | GCA_018127125.1_RGv1.1_genomic | 系統名 | wild accession |
配列数 | 1,677 | 染色体数 | 2n = 40 |
配列長 (bp) | 511,771,795 | N50長 (bp) | 22,146,478 |
遺伝子の数 | 31,673 | 遺伝子数由来ファイル | GCA_019321725.1_Paulownia_fortunei_Genome_V1.0_protein.faa.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio, Illumina, Hi-C | 取得した配列量 | 90x(Hi-C), 87.3x(PacBio), 89x(Illumina) |
アセンブリ方法 | WTDBG (v.1.2.8) | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 552(k-mer), 528.4(flow cytometry) |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Guoqiang Fan (Henan Agricultural University) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1016/j.molp.2021.06.021 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |